员工旷工的扣除方式主要依据公司的规章制度和相关法律规定。以下是一些常见的处理方式：
按日计算工资
旷工一天通常扣除当天的日工资。
累计旷工时间计算
累计旷工时间一般以当年为限，不跨年度。连续旷工的时间可以跨年度计算。
经济处罚
旷工0.5个工作日，扣除当日日薪。
旷工1个工作日，扣除当月月薪的20%。
旷工1.5-2个工作日，扣除当月月薪的40%。
旷工2.5-3个工作日，扣除当月月薪的60%及当年度奖金总额的20%。
旷工3个工作日以上，扣除当月月薪的100%及当年度奖金总额的40%。
严重违纪处理
连续旷工超过3个工作日，或一年内累计旷工超过10个工作日（含），作严重违纪处理，除扣除当月月薪及当年度奖金总额外，公司有权与其即时解除劳动合同，且不给予任何经济补偿。
节假日扣除
在计算旷工时间时，节假日的天数应扣除。
不得克扣工资
旷工只能按事假扣工资，不能旷一天罚三天，这种做法是违法的。
其他处罚方式
有些单位可能会采用其他方式，如行政处罚，而不是直接克扣工资。
建议
制定明确规章制度：公司应制定明确的考勤制度和旷工处罚细则，确保所有员工都清楚了解相关规定。
公平处罚：处罚应公平合理，避免因个别案例影响整体制度的公正性。
沟通与协商：在处理旷工问题时，应先与员工进行沟通，了解原因，尽量通过协商解决。
法律途径：如果员工对处罚有异议，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自身合法权益。
这些规定和处罚方式旨在维护公司的正常运营和员工的权益，同时也提醒员工应遵守公司制度，按时出勤。
