当审计过程中发现问题时，应当采取以下步骤进行处理：
记录问题
审计人员应当对发现的问题进行详细记录，包括问题的性质、涉及的金额、影响范围等。
同时，需要注明相应的证据和依据，以便后续处理。
分析问题
审计人员需要对发现的问题进行分析，包括问题的原因、影响、风险等。
通过分析，可以更好地了解问题的实际情况，为后续处理提供参考。
通知相关人员
审计人员需要及时通知相关人员，包括被审计单位、上级领导、监管机构等。
通知应当包括发现的问题、建议的解决方案等。
采取措施
根据问题的性质和影响范围，审计人员可以建议被审计单位采取相应的措施，如调整账务、补缴税款、追回资产等。
同时，需要确保措施的合法性和有效性。
跟踪进展
审计人员需要跟踪问题的处理进展，及时向相关人员提供反馈和报告。
同时，需要确保问题得到妥善解决，避免产生后续影响。
总结经验
在问题处理完毕后，审计人员应当总结经验教训，以便改进未来的审计工作。
此外，审计报告应当遵循《中华人民共和国国家审计准则》第一百二十三条第一款第六项的规定，确保审计发现的问题定性、处理、处罚的依据标准明确，事实清楚、证据确凿、定性准确、处理合法、处罚适当。
如果被审计单位对审计决定有异议，可以依法申请行政复议或向法院提起诉讼，以维护其合法权益。
建议被审计单位高度重视审计发现的问题，并采取切实有效的措施进行整改，确保问题得到彻底解决，避免类似问题再次发生。
